重庆地区地下水年储量为131.7亿立方米，可开采量为44.9亿立方米。全市碳酸盐岩类出露面积2903平方公里，占全市总面积35.3%，喀斯特水占地下水总量的78%，主要分布于大巴山、武陵山地；基岩裂隙水仅占6%，分布于西部红层丘陵区。
据不完全统计，重庆境内温泉26处(不含原涪陵及黔江地区)，水温属低温热水(20℃～40℃)有19处；中温热水(40℃～60℃)有南泉等6处；高温热水(大于60℃)1处。水质类型70%属硫酸盐型热，并含有氧、溴、碘、锶等多种微量元素。同时经勘探钻孔证明，重庆地区地下热水储量极为丰富。地下热水不仅具有旅游、疗养等功能，而且是有待开发的宝贵能源资源。
3.土地资源
重庆土地总面积82339.36平方公里，其中农用地为61634平方公里，占土地总面积的74.85%，耕地面积25564平方公里，占土地总面积的31.05%；林地30078平方公里，占36.53%；园地1626平方公里，1.98%；牧草地占2059平方公里，占2.5%；水面2307平方公里，占2.79%。1996年人均土地仅为0.273公顷，为全国人均的1/3；人均耕地0.084公顷，比全国人均少0.02公顷；人均林地0.1公顷，比全国人均少0.087公顷，人均草地0.007公顷，仅有全国人均草地的1/33。
4.生物资源
植物资源
重庆自然植被属亚热带常绿阔叶林，其主要由栲树属、青罔属、栎属、木兰属等树种构成。重庆地区自第四纪以来，未受冰川“入侵”，成为植物的“避难所”，有维管束植被1154种。孑遗植物和珍稀植物极为丰富，属国家1～3级保护植物多达50多种，其中一级保护植物有银杉、水杉、珙桐、秃杉、桫椤等。水杉(万州盐井溪)、银杉(南川金佛山)均为我国最早发现地区，曾轰动了世界。二级保护植物有银杏、光叶珙桐、香果树、鹅掌楸、红豆杉等；三级保护植物有黄杉、穗花杉、白桂木等。
动物资源
重庆动物种类繁多，有兽类69种、鸟类191种、爬行类27种、两栖类28种、鱼类146种，其中属于国家保护珍稀动物有40多种。国家一级保护动物主要有金丝猴、黑叶猴、云豹、白鹤、中华鲟、长江鲟等；国家二级保护动物有金冠鹿、穿山甲、林麝、水獭、大鲵等；国家三级保护动物有青羊、小灵猫、白腹锦鸡等。上述珍稀生物种类，不仅具有很高的观赏价值，更重要的是它们与生息繁衍的自然环境构成“生物基因库”，是研究生态环境变迁和生物演化的宝贵场所。
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